|
Создали молекулярную карту человеческого организма
|
|
|
|
Ученые из медицинского центра Weill Cornell в Катаре (WCM-Q) создали сложную молекулярную карту человеческого организма и его сложных физиологических процессов на основе анализа тысяч молекул в образцах крови, мочи и слюны 391 добровольца. Полученные данные были объединены для создания мощного интерактивного визуального веб-инструмента под названием Connecting Omics (Комиксы), который может быть использован для изучения сложного молекулярного строения человека и выявления основных черт, связанных с различными заболеваниями.
|
|
|
|
Молекулярные процессы человеческого организма относятся к химическим реакциям и взаимодействиям, происходящим внутри клеток и между различными клетками, включая такие важные функции, как репликация ДНК, синтез белка, выработка энергии, клеточная коммуникация и различные метаболические пути, которые регулируются сложными взаимодействиями белок-белок, белок-ДНК и белок-РНК, в конечном счете, это обеспечивает жизнедеятельность организма.
|
|
|
|
В этом исчерпывающем исследовании, опубликованном 19 августа в журнале Nature Communications, собраны данные за 12 лет, полученные в ходе катарского метаболомического исследования диабета (QMDiab), исследования "случай-контроль диабета" среди многонационального населения Катара, преимущественно арабского, филиппинского и индийского происхождения.
|
|
|
"Наша идея состояла в том, чтобы объединить все, что мы узнали за более чем десятилетие исследований в области мультиомики, для создания всеобъемлющей молекулярной модели человеческого организма и процессов, происходящих в нем", - сказал старший автор доктор Карстен Зуре, профессор физиологии и биофизики и сотрудник Английского института точной медицины. - Этот справочный инструмент доступен для бесплатного использования исследователями, которые хотят исследовать, как работает человеческий организм на молекулярном уровне, а также для формирования гипотез, которые можно проверить экспериментальным путем".
|
|
|
|
В сотрудничестве с Hamad Medical Corporation исследователи собрали множество образцов крови, мочи и слюны у добровольцев с сахарным диабетом и без него. Впоследствии образцы были охарактеризованы на 18 различных высокопроизводительных аналитических платформах, что позволило получить чрезвычайно богатый набор данных, включающий 6300 отдельных молекулярных точек, включая геномные данные (ДНК), транскриптом (РНК), белки и метаболиты, такие как аминокислоты, сахара и жиры. Кроме того, они определили информацию о генетических вариантах, участках метилирования ДНК и экспрессии генов для каждого из участников.
|
|
|
|
Это позволило исследователям обнаружить ассоциации и пути, связывающие генетические характеристики с конкретными белками, метаболическими процессами и заболеваниями. Затем они кропотливо объединили массу данных обо всех людях в онлайн-инструмент, служащий интерфейсом для "Молекулярного человека", молекулярного описания человеческого тела.
|
|
|
|
Подход, сочетающий геномные, транскриптомные, метаболомные, протеомные и другие формы так называемых омических исследований, известен как мультиомика. В последние годы этот подход стал ключевой стратегией для биомедицинских исследователей, стремящихся понять, как на самом деле функционирует человеческий организм и болезни, и дает информацию, которая потенциально может помочь в разработке новых методов медикаментозного лечения.
|
|
|
|
Например, в ходе исследования были выявлены и описаны белки и метаболиты, которые являются признаками подтипов сахарного диабета 2 типа, что проливает свет на различные проявления этого заболевания.
|
|
|
|
"Наш интегративный омический подход дает представление о взаимосвязях между различными молекулярными признаками и их связи с фенотипом человека — их наблюдаемыми чертами, такими как внешний вид, биохимические процессы и поведение", - сказала первый автор доктор Анна Халама, доцент кафедры исследований в области физиологии и биофизики.
|
|
|
|
"Масштаб данных, интегрированных в веб-инструмент COmics, предоставляет исследователям доступ к сотням тысяч путей и ассоциаций для изучения, что открывает огромный потенциал для открытий и исследований".
|
|
|
|
Источник
|
