ИИ ускоряет открытие лекарств в 10 раз
Усиление виртуального скрининга с помощью машинного обучения позволило в 10 раз сократить время обработки 1,56 миллиарда молекул, подобных лекарствам. Исследователи из Университета Восточной Финляндии объединились с промышленностью и суперкомпьютерами, чтобы провести один из крупнейших в мире виртуальных тестов на наркотики. В своих усилиях по поиску новых молекул лекарств исследователи часто полагаются на быстрый компьютерный скрининг больших библиотек соединений для выявления агентов, которые могут блокировать мишень лекарства. Такой мишенью может быть, например, фермент, который позволяет бактерии противостоять антибиотикам или вирусу, заражающему своего хозяина. За последние годы размер этих коллекций небольших органических молекул значительно увеличился. Поскольку библиотеки растут быстрее, чем скорость компьютеров, необходимых для их обработки, проверка современной библиотеки соединений размером в миллиард миллиардов долларов на предмет только одного лекарственного препарата может занять несколько месяцев или лет — даже при использовании самых современных суперкомпьютеров. Поэтому совершенно очевидно, что крайне необходимы более быстрые подходы.
В исследовании, опубликованном в Журнале химической информации и моделирования, доктор Ина Пёнер и ее коллеги из Фармацевтической школы Университета Восточной Финляндии объединились с организацией, располагающей мощными финскими суперкомпьютерами, CSC — IT Center for Science Ltd — и промышленными партнерами. из Orion Pharma, чтобы изучить перспективы машинного обучения для ускорения виртуальных экранов гигамасштабного масштаба. Прежде чем применить искусственный интеллект для ускорения скрининга, исследователи сначала установили базовый уровень: в ходе виртуальной скрининговой кампании беспрецедентного масштаба 1,56 миллиарда молекул, подобных лекарствам, были оценены по двум фармакологически значимым мишеням в течение почти шести месяцев с помощью суперкомпьютеров Mahti и Пухти и молекулярный докинг. Докинг — это вычислительный метод, который помещает небольшие молекулы в область связывания мишени и вычисляет «оценку стыковки», чтобы выразить, насколько хорошо они подходят. Таким образом, сначала были определены показатели докинга для всех 1,56 миллиарда молекул.
Затем результаты сравнили с экраном, усиленным машинным обучением, с использованием HASTEN, инструмента, разработанного доктором Туомо Каллиокоски из Orion Pharma, соавтором исследования. «HASTEN использует машинное обучение для изучения свойств молекул и того, как эти свойства влияют на оценку соединений. При наличии достаточного количества примеров, взятых из обычного стыковки, модель машинного обучения может предсказать показатели стыковки для других соединений в библиотеке гораздо быстрее, чем модель машинного обучения. подход к стыковке методом грубой силы», — объясняет Каллиокоски. Действительно, поскольку только 1% всей библиотеки был закреплен и использован в качестве обучающих данных, инструмент правильно определил 90% соединений с лучшими оценками менее чем за 10 дней. Исследование представляет собой первое тщательное сравнение инструмента стыковки с использованием машинного обучения с обычным базовым вариантом стыковки в гигамасштабе. «Мы обнаружили, что инструмент с поддержкой машинного обучения надежно и многократно воспроизводит большинство наиболее эффективных соединений, выявленных с помощью традиционной стыковки, в значительно более короткие сроки», — говорит Пёнер.
«Этот проект является отличным примером сотрудничества между академическими кругами и промышленностью и того, как CSC может предложить один из лучших вычислительных ресурсов в мире. Объединив наши идеи, ресурсы и технологии, стало возможным достичь наших амбициозных целей», — сказал профессор. Антти Посо, возглавляющий группу по разработке компьютерных лекарств в Исследовательском сообществе лекарственных технологий Университета Восточной Финляндии. Исследования сопоставимого масштаба в большинстве случаев остаются неуловимыми. Таким образом, авторы выложили в открытый доступ большие наборы данных, созданные в рамках исследования. Их готовая к использованию библиотека скрининга для стыковки позволяет другим ускорить свои усилия по скринингу, предоставляя 1,56 миллиарда результатов стыковки соединений для двух целей, которые можно использовать в качестве сравнительных данных. Эти данные будут стимулировать будущую разработку инструментов для экономии времени и ресурсов и в конечном итоге будут способствовать развитию области компьютерного открытия лекарств.
Источник
Последние аномальные новости

Где находятся двойные экзопланеты

Да пребудет с нами словарь Звездных войн

Двойные сверхмассивные черные дыры сложно обнаружить

ИИ угрожает заработной плате, а не рабочим местам

Инновационный метод сопоставления небесных объектов

Инопланетная дымка проясняет вид на далекие водные миры

Истребители поднялись в воздух, когда НЛО завис над аэропортом

Компания Neuralink никогда не убивала обезьян

Моделирование образования звездных элементов

Мумифицированные инопланетяне принадлежат к неизвестному виду

НЛО и космическое пространство

Протопланетные диски обнаружены в соседнем звездном скоплении

Семью с загадочной болезнью сравнили с инопланетянами

Скоро мы будем получать изображения землеподобных экзопланет

Телешоу попытается вызвать НЛО в прямом эфире

Темная материя может помочь решить проблему черных дыр

Тиктокерша запечатлела, как НЛО исчезает во вспышке света

Три загадочные двери, спрятанные внутри Великой пирамиды

Через пять лет ИИ будет конкурировать с людьми

Что будет с Землей, если близко подойдет звезда-изгой

Чип-тюнинг. Оптимизация мощности автомобиля

Американские военные видят НЛО в космосе

Биогибридные микророботы смогут удалять микропластик

Везикулы доставят сообщения от нечеловеческих клеток

Выявили импульсы гамма-излучения от черной дыры Стрелец А

Два католических писателя приняли участие в уфоконференции

Идеальные часы невозможны

Исследование взаимодействия темной материи и нуклонов

Китай начинает массовое производство роботов-гуманоидов

Коллайдеры раскроют пространственно-временную геометрию

Новые ограничения на наличие сверхлегкой темной материи

Обнаружили искусственную звездную систему

Обнаружили ультратусклую карликовую галактику

Отслеживание странных обьектов в космосе

Пара испытала покалывание в позвоночнике от НЛО

Пилот авиакомпании сообщил о наблюдении НЛО в Бостоне

Политик пытается добиться прозрачности в вопросе НЛО

Почему такая секретность. Просто идите по следу денег

Распутывание отношений между бактериальными языками

Свидетель заметил в небе три жутких красных огня

ЦРУ собрало коллекцию космических кораблей инопланетян

Займ на Карту 3000 Онлайн. Быстро, Удобно, Без Замедлений

Встречались ли ВМС США с НЛО в 1947 году

Выявили 200 новых видов CRISPR-систем для биотехнологий

Выявление самых ранних стадий развития звезд

Гэри Маккиннон пытался раскрыть правительственные тайны

Звезды-экстремалы обладают уникальными свойствами

ИИ ищет новые фармацевтические ингредиенты

ИИ обнаружил шлейфы метана из космоса

Индийский телескоп обнаружил свою первую сверхновую

Исследователи создают ИИ, открывающий ферменты

Как бактерии защищаются от плазмы

Как правильно сплайсируется РНК

Как розуэлльский НЛО стимулировал теории заговора

Неважно сколько инопланетян прячет США

Новая последовательность кластера генов человека

Орбиты для интерферометров космического базирования

Основы и применение оптических наночастиц

Открыли десятки гигантских радиогалактик

Расследования НЛО и поиски инопланетной жизни

Секретный офис ЦРУ искал следы крушений НЛО

Создание высокоэнергетических сверхбыстрых лазеров

Биоинспирированные коллективы активной материи

Будущее гибридной работы

Древний храм обнаружен в Рендлшеме

Жуткие случаи с привидениями и проклятой мебелью

Заброшенные спутники склонны падать

Звездные войны являются частью английского языка

ИИ распознает темп и стадии эмбрионального развития

Климат формирует особенности жизненного цикла

Мозг свидетелей НЛО претерпевает изменения

НЛО глушили ядерные ракеты

НЛО и ядерные ракеты

НЛО осматривают атомные электростанции

Пилот British Airways рассказал о своих встречах с аномальным

План возрождения разговорной речи та ре Мориори

Структурные вариации играют роль в видообразовании

США на грани катастрофического раскрытия НЛО

Удалось вырастить доломит в лаборатории

Упадок СМИ ставит под угрозу сплоченность общества

Это было просто НЛО

Ясность в отношении изменения климата и его последствий

Речная галька. Ключевые достоинства материала

Ремонт 'под ключ'. Основные плюсы услуги

Базы инопланетян спрятаны под водой у берегов Аляски

Бактерии поддерживают друг друга из поколения в поколение

Джон Кеннеди был реинкарнацией Линкольна

ИИ может обнаружить устойчивость к антибиотикам за 30 минут

Инопланетян терроризирующих жителей Перу удалось снять

Исследовали недавно обнаруженную новую звезду

Как петли влияют на пространственную организацию генома

Межзвёздные шарики оказались отходами тяжёлой промышленности

Мужчины получают больше пользы от привлекательности

НЛО застал врасплох крошечный порт Лабрадора

Обнаружили зеленое свечение Марса

Одна из книг об НЛО, которую необходимо прочитать

Призрачная фигура попала на камеру наблюдения

Проверка достоверности между взаимно не доверяющими сторонами

Разговоры об ИИ имеют прямое отношение к политике

Сколько инопланетян может быть на Земле

Создание вихрей в сверхтекучей жидкости из света

Тестирование будущих конструкций марсианских вертолетов

Углеродный материал установил рекорд по хранению энергии

Эксперименты с ИИ важны для нашего коллективного обучения

Бактерии хранят воспоминания и передают их потомкам

Галактики используют периоды затишья для производства звезд

Двуязычный мозг лучше игнорирует ненужную информацию

Динозавры все еще могут существовать на других планетах

Добыча полезных ископаемых на Луне реальна

Инопланетяне и динозавры вместе гуляли по Земле

Инопланетяне существуют, но им плевать на нас

Инопланетяне существуют, об этом говорят тысячи экзопланет

Мировая элита не сможет сохранить контроль над ИИ

Мощные волоконные лазеры становятся новаторской технологией

Мужчина застыл от страха, увидев НЛО

Новая детская книга об НЛО

Новые свидетельства о Британском Розуэлле

Обнаружили скрытые в Европе загадочные мегаструктуры

Основа контроля природы нелинейностей

Радикальный взгляд на галактики, окружающие Млечный Путь

Редкий металл станет переключателем для квантовых устройств

С отрицанием покончено, изменение климата происходит

Теории заговора вокруг убийств, от Джона Кеннеди до Ганди

Юные галактики горячие и светятся странными элементами

Билл Гейтс пообещал трехдневную рабочую неделю благодаря ИИ

Бывший офицер ВВС рассказал подробности о НЛО

В небе над Челябинском сняли загадочный объект

Веха, знаменующая появление квантовых компьютеров

Вклад гамма-блазарных вспышек в поток нейтрино

Живой Нострадамус предсказывает волну стихийных бедствий

Загадка отсутствия спиральных галактик в Супергалактической плоскости

Зафиксировали мощный луч неизвестной природы

ИИ нашел формулу прогнозирования гигантских волн

Квантовые вычисления для прогнозирования взаимодействия генов

Миры, в которых инопланетяне на миллиарды лет старше нас

Над аэропортом Импхал замечен НЛО

Необьяснимые обьекты в сердце нашей галактики

Разбившийся НЛО с живыми существами-андроидами внутри

Разгадали 400-летнюю загадку первых взрывчатых веществ

Революционные исследования в хранении энергии

Совместили два световых луча, скрученных по часовой стрелке

Странные и загадочные случаи, связанные с близнецами

У нас нет технологий, распознающих творчество нейросетей

Чтобы изучить нептуний и плутоний нужна новая химия

Астрология расскажет насколько вы чувственны в постели

Британская Зона 51 скрывает НЛО и лабиринт туннелей

Виртуальная реальность влияет на психику и креативность

Доказательства экзотического переноса заряда

Компания OpenAI совершила прорыв в создании сильного ИИ

Метеорит пробил насквозь автомобиль в Страсбурге

Множество свидетелей видели снежного человека

Найдите загадочное животное в оптической иллюзии

НЛО врезался в Юпитер

Ноев ковчег найден на Google Earth

Обнаружили второй по силе космический луч

Обнаружили два горячих Юпитера вокруг красных гигантов

Почему интерес к НЛО снова в центре внимания

Сатанинский клуб после школы открылся в Коннектикуте

Секретный военный объект для уничтожения НЛО

Сеть туннелей с привидениями обнаружена в Глостершире

Сокрытие НЛО правительством США реально

Статуя Девы Марии заплакала в Мексике

Хитрая оптическая иллюзия с 10-ю лицами

Шифрование квантовой информации в открытых системах

Бактерии способствуют модуляции поведения животных

Древнюю каменную стену нашли на Марсе

Житель Харрисонбурга рассказал о наблюдении НЛО

Индия поднимает истребители на перехват НЛО

История о крошечном человечке на самолетике

История поисков правительством США инопланетной жизни

Какова истинная природа эффекта Матильды

Климатические теории заговора процветают

Метан и водяной пар обнаружили в атмосфере экзопланеты

Молодая галактика содержит слишком много металла

Мышь с крысиным сердцем и сосудами не получилась

НЛО пролетел в 20 метрах от самолета на высоте 4000 футов

Нострадамус предсказал, что 'Вода смоет города'

Опровергли теорию странных маленьких воздушных шариков

Открываются новые горизонты для технологий будущего

Пентагон скрывает трупы разнообразных инопланетных существ

Российские пилоты заметили мерцающий НЛО

Сетевые нанобиосенсоры для беспроводной связи в крови

Сталкеры пробрались в самый опасный город в мире

Что нужно сделать чтобы предотвратить падение астероида

Бессмертие станет катастрофой для нашей планеты

Вода на поверхности Луны может стать важным ресурсом

Подписка на новости
Наверх
Яндекс.Метрика