Создали новый инструмент для редактирования генома
Биологи создали инструмент для геномного редактирования, основанный на ретронах — бактериальных генетических элементах. Они позволяют синтезировать внутри клетки одноцепочечную ДНК, которая и служит матрицей для рекомбинации и встройки небольшой последовательности в геном. Такой инструмент оказался полезным для создания и анализа большого количества генетических вариантов, а также более эффективным, чем CRISPR-методы. Исследование опубликовано в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
На основе защитного механизма бактерий уже создан инструмент редактирования генома — CRISPR\Cas. В состав этого комплекса входит фермент Cas9, который вносит в геном разрывы, и направляющая РНК для доставки белка в нужный локус. Открытие этой системы стало настоящим фурором для биологов — в прошлом году за него даже присудили Нобелевскую премию. Однако даже у такого популярного инструмента есть свои ограничения: так, например, CRISPR\Cas в основном применяют для создания крупных делеций или вставок в геноме. Для создания же большого количества маленьких мутаций в разных клетках этот способ не так удобен.
Для внесения небольших мутаций сейчас используют небольшие одноцепочечные фрагменты ДНК — олигонуклеотиды, которые доставляют в клетки бактерий. Там они находят участки гомологии с геномом и служат матрицей для синтеза новой цепи при удвоении генома. Однако такой способ не подразумевает использование маркеров мутаций: светящихся белков или генов устойчивости к антибиотикам. То есть отследить клетки, в которых прошла рекомбинация после внедрения последовательностей, сложно.
Биологи из медицинской школы Гарварда под руководством Макса Шуберта (Max G. Schubert) создали новый инструмент редактирования генома, который способен вносить разнообразные точечные мутации и включает маркеры для отбора клеток. Этот метод основан на защитном механизме бактерий — ретронах. Ретрон — это небольшой фрагмент одноцепочечной ДНК, который обоими концами прикреплен к фрагменту РНК. Такая молекула получилается в результате считывания ДНК с матрицы РНК (обратной транскрипции) при помощи ретро-транскриптазы.
Исследователи поместили последовательность ДНК ретрона в плазмиду, которую внедрили в клетки бактерий. Внутри клетки в ходе транскрипции с последовательности ДНК синтезировались РНК ретрона. А уже после транскрипции небольшая часть ретрона подверглась обратной транскрипции, в результате чего получались небольшие кусочки одноцепочечной ДНК внутри РНК-молекул. Эти фрагменты ДНК и использовались в качестве доноров в процессе удвоения генома, как и в более ранних методах с олигонуклеотидами.
Сначала такой способ работал не так эффективно, как хотелось бы ученым — среди бактерий, в которые помещалась плазмида, образовывалось слишком мало мутантных клонов. Тогда биологи инактивировали у бактерий гены экзонуклеаз — ферметов, которые расщепляют свободные ДНК и РНК. Также для повышения эффективности исследователи отключили и ферменты мисматч-репарации, чтобы клетка не распознавала и не исправляла две несовпадающие цепи: изначальную и отредактированную. После таких изменений эффективность метода превысила 90 процентов, что в целом даже больше, чем у CRISPR-методов.
Авторы также показали и другое преимущество своей модели — способность маркировать мутантные клетки, чтобы определять их в процессе экспериментов. Для этого они выбрали устойчивость к антибиотикам. Если наделить таким свойством все мутантные клетки и обработать все бактерии антибиотиком, выживут только клетки с мутациями, что и позволит их отличить. Для устойчивости к антибиотикам авторы предложили помимо целевых мутаций для исследования вносить еще и те, что направлены на гены, связанные с устойчивостью. Они протестировали свой подход на целом наборе мутаций, вызывающих у бактерий E.Coli устойчивость к антибиотику рифампицину, и показали его эффективность.
Главное потенциальное применение геномного редактирования с использованием ретронов — внесение небольших мутаций. Такой подход может быть использован, например, для создания большого количества генетических вариантов, чтобы имитировать их влияние на приспособленность и эволюцию. Чтобы имитировать эволюцию каждого варианта из одного генома, биологи предложили фрагментировать этот геном и поместить фрагменты в ретроны, после чего внести каждый вариант в отдельную клетку. Биологи провели такой эксперимент на E.Coli и показали, что в ее геноме действительно можно выделить мутации, дающие преимущество в ходе эволюции — устойчивость к антибиотикам.
После создания первых систем редактирования генома биологи продолжают оптимизировать их и даже создавать новые. Так, например, ученые недавно увеличили эффективность CRISPR\Cas при помощи фотоиндукции, а также создали инструмент, который способен редактировать несколько генов одновременно и вырезать из них участки. Также биологи научились редактировать не только ДНК, но и эпигеном — модификации нуклеотидов и белков, которые влияют на активность генов.
Источник
Последние аномальные новости

Воду Ноя обнаружили в Кольской сверхглубокой скважине

Имитация жизни на Марсе

Инопланетяне всегда были на Земле

Казненных ведьм оправдали в Коннектикуте

Как лучше всего избавиться от криптозоологического существа

Когда-то в озере Лох-Несс жило еще одно чудовище

Могут ли бигфуты быть хорошими пловцами

Морские монстры с человеческими руками

НЛО над Коннектикутом. Круги и огненные шары

НЛО над крупной базой морской пехоты США

Око Сахары - Атлантида. Есть ли достаточные доказательства

Опасные монстры в шотландских озерах

Открывается туристический центр лохнесского чудовища

Пилот заметил НЛО, наблюдая за звездами

По меньшей мере 119 НЛО потерпели крушение на Земле

Программы анализа материалов и обратного проектирования НЛО

Странные случаи пойманных морских и озерных чудовищ

Существует ли древняя подземная цивилизация

Тайна мумии человека-крысы

Троуп среди 46 городов Техаса, в которых видели НЛО

Афганский пророк-математик рассказал о будущем

Владелец ранчо Скинуокеров поделился историей об НЛО

Глаза статуй Древнего Египта - дар или что-то другое

Жуткий город-призрак тайно купили за $22 млн

ИИ-фейки наводнили интернет перед выборами в США

Информационная карточка о НЛО министерства обороны США

Использование ChatGPT в классе финансовых технологий

Как высоко бы ты прыгал на других планетах

Каталогизируют все известные трехзвездные системы с планетами

Корпорация Microsoft призвала создать агентства для регулирования ИИ

Мощность ИИ возрастет в 100 тыс. раз за 10 лет

Мрачный Жнец реален и бродит по Великобритании

Объявлены хедлайнеры фестиваля НЛО в Розуэлле

Очевидцы могут сообщить о НЛО через приложение Enigma

Первое свидетельство редкого распада бозона Хиггса

Потенциально опасный астероид скоро сблизится с Землей

Пристальный взгляд на треугольный НЛО Мохаве

Странная система может содержать звезду из темной материи

Черные проекты Вашингтона вокруг НЛО

Экзорцисты могут ненамеренно помогать дьяволу

Брокер Squire’s Finance Limited, отзывы о squiresfinanceltd.com

Гемблинг копирайтер - написание текстов по гэмблинг тематике

Богатые железом породы открывают понимание истории Земли

Внезапно скончался известный конспиролог

Загадки, вдохновившие на создание Индианы Джонса

ИИ может быть использован для убийства людей

Ионизация, вызванная давлением, на планетах-гигантах

Ключевая планетарная система для понимания механизма образования загадочных суперземель

Компания Neuralink получила разрешение на вживление чипов людям

Лечение-плацебо вернуло зрение слепой женщине

Мальчик считает себя реинкарнацией модельера Гуччи

Метеоритные частицы могли способствовать возникновению жизни

Наблюдения необъяснимых явлений в Шеффилде

НЛО заметили в Стаффордшире

Новое представление о быстрых радиовсплесках

Новые методы проверить общую теорию относительности

Новый способ расширить зону поиска обитаемых экзопланет

Обнаружена новая экзопланета супер-Нептун

Роль метеоритного железа в возникновении жизни на Земле

Спинной мозг подключили к головному и вернули человеку подвижность

Ученым пора бы уже исследовать НЛО

Эксперты анализируют кадры с НЛО над военной базой

Создание сайта с высокой конверсией. Рекомендации и советы

Как найти официальный сайт UGG

Волшебная технология может провести сеанс с умершими

Два летчика-истребителя пытались сбить НЛО

Дискообразный НЛО пролетел над Калифорнией

Загадочные перемещения в другую реальность

Зародыш сверхмассивной черной дыры заметили рядом с Землей

Зафиксировали смоделированный сигнал инопланетян

ИИ может уничтожить поисковые системы

ИИ создали для ведения войн

Интервью с автором книги 'НЛО - реальная история'

Каменный шквал сметал все на своем пути

Летающие тарелки над столицей

НЛО - Близкий контакт. Правдивая история Кэлвина Паркера

НЛО преследовал пассажирский самолет

Огни Денби - правдивый аргумент в пользу существования НЛО

Пришельцы на Земле уже давно

Пророчество Мессинга о судьбе России

Прорыв в области квантовой материи

Устройство в стиле Звездного пути собирает энергию из воздуха

Юпитерианские молнии оказались медленнее земных

Ясновидящий Кейси предсказал объединение России и Китая

Сбербанк расчетный счет для ИП. Тарифы и условия открытия

Астроном успокоил повальное увлечение НЛО в Китае

Документальные фильмы об инопланетянах и НЛО

Жизнь на Земле быстро стала независимой от молнии

ИИ уже используется в правовой системе

Инженеры сделали полностью мягкий электродвигатель

Инопланетяне не настолько развиты, мы одни во Вселенной

Использование ИИ в мире финансов

Как узнать атмосферу далеких лавовых миров

Квантовую информацию передали на десятки километров

Мальчик в Nike замечен на картине 400-летней давности

Метеорит взорвался над Австралией

Начинается эксперимент по поиску темной материи

НЛО вызвал срыв рейсов в тайваньском аэропорту

Обнаружили полярный циклон на Уране

Отсутствие симметрии может объяснить наше существование

Подземная лаборатория содержит ключ к обитаемости Марса

Создана эластичная электронная кожа

США пока не нашли доказательств внеземной жизни

Черный треугольный НЛО завис над военной базой в Калифорнии

Эмоциональные роботы займут миллионы рабочих мест

Автомобиль инопланетян заметили над Йоркширом

Встречи с волосатыми мини-существами

Древний северный океан существовал на Марсе

Женщина год прожила в плену у бигфута и родила

Жителей Манитобы пригласили посетить место встречи с НЛО

Загадка потрясающего изменения цвета Юпитера

Испытан прибор для измерения гравитации на астероидах

Исследуют внутреннее пылевое кольцо молодой звезды

Как ИИ изменит мир к 2030 году

Команда ученых смоделирует сообщение от внеземного разума

Мечты о коммерческой космической станции

НЛО замечен на картине возрастом 1000 лет

Первый контакт с инопланетянами займет недели или месяцы

Робот с искусственным интеллектом уже работает охранником

Телескоп нового поколения хотят построить в Аресибо

Ужасная рыба, органы которой торчат изо рта

Ученые считают НЛО достойным академического изучения

Ученый разгадал тайну Бермудского треугольника

Хищный динозавр из джунглей Конго

Что скрывают в закрытых архивах Ватикана

Атака НЛО на базу ВВС напугала охранников

Внеземная история Орегона

Загадочного исчезновения пилота ВВС США

Загадочный шар навестил хозяина дома

Замечен НЛО, летящий зигзагами по небу

Инопланетный корабль замечен в небе над Розуэллом

Корабли инопланетян замечены над Луной

Крохотные сферы на местах крушений НЛО

Место крушения НЛО в Розуэлле

Напуганный прохожий говорит, что НЛО нырнул в море

НАСА проводит публичную встречу по НЛО

НЛО выглядело как машина из Рыцаря дорог

Привидение сняли на руинах монастыря Росс

Призрачная фигура замечена у берегов Великобритании

Самое убедительное наблюдение Лох-Несского чудовища

США обратно перепроектируют сбитые НЛО

Тайна странных огней в небе Сакраменто

Убедительные свидетельства о встречах с НЛО

Уфолог утверждает, что мы не одиноки

Уфологический фестиваль прошел в Макминнвилле

TexTovich.com - тексты, статьи и новости для сайтов

Биржа Postimus.com - продвижение сайта с помощью статей и SEO-ссылок

Chat GPT на русском - генерируй тексты с chatgptmarket.ru

Беттинг копирайтер - написание текстов по Бэттинг тематике

Бывший пилот был ошеломлен, заметив над головой НЛО

Военный самолет преследовал НЛО над Халлом

Демистификация вихревых колец в ядерном синтезе

Десятки рейсов отменили из-за НЛО в Газиантепе

Добились искривления пространства-времени на квантовом симуляторе

Дождь из белых личинок порошел в Индии

Жирные кислоты могут существовать в космосе

Жители против строительства турцентра в сакральном месте

Загадочные светящиеся объекты сняли над Техасом

Западный Техас облюбовали инопланетяне

ИИ катализирует исследования активации генов и ДНК

ИИ может рассматривать людей как подонков, которых нужно контролировать

Инопланетные кошки бродят по сельской местности Великобритании

Инопланетяне вторгаются в Макминнвилль

Истории о Вендиго, описанные торговцем мехом

Каковы причины странных наблюдений в небе Сассекса

Министерство обороны США проводит оценку неопознанных явлений

На Энцеладе заметили гейзер рекордной силы

НЛО шпионят за Бельгией

Одержимая подпрыгнула в воздух, шипя, как кошка

Один параллельный мир не может сильно отличаться от другого

Озеро шайтана, йети и осколки НЛО

Потусторонние места Великобритании

Проект Синяя книга. Встреча с НЛО Чайлза и Уиттеда

Рентгеновский взгляд на сердце мощных квазаров

Сообщения Трэвиса Тейлора и его усилия по исследованию НЛО

Таинственные стены в пространстве и искажение времени

То, что говорят о загробном мире - правда

Треугольный НЛО сняли в Испании

Увидев НЛО в Глазго, я вдохновился на песню для Евровидения

Астероид врежется в Землю в течение 1000 лет

Астрономам нужна ваша помощь в охоте на астероиды

Вот как выглядят идеальные мужчина и женщина

Инопланетянина сняла полицейская камера

Использование ИИ для поиска редких минералов

Как будут выглядеть американские города в 2050 году

Красная новая пожирает свою планету

Подписка на новости
Наверх
Яндекс.Метрика